Validación de genes de referencia para muestras de carcinoma renal del Banco de Tejidos Tumorales del INEN mediante RT-qPCR

Abstract

El presente estudio tuvo como objetivo la validación de genes de referencia (GR) en muestras de carcinoma renal de células claras (CRCC) mediante la Reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR) en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). Se evaluó la expresión de 11 genes de referencia candidatos previamente reportados en la bibliografía en otras poblaciones: GAPDH, GUSB, RPL13, TBP, HMBS, PPIA, HPRT1, ACTB, B2M, RPN1, y RNA18S mediante RT-qPCR en muestras tumorales y no tumorales de 21 pacientes del INEN con diagnóstico patológico de CR de células claras utilizando el software geNorm. Además, para presentar la importancia de la selección adecuada de genes de referencia, la expresión relativa de los genes de interés TP53 y EGFR fue calculada con los genes de referencia validados usando el método Delta-delta Ct. El análisis de la expresión de los genes candidatos permitió determinar que, entre los genes evaluados, TBP, GUSB y HMBS presentaron estabilidad alta (valor geNorm M ≤0.5) tanto en muestras tumorales como no tumorales. El cálculo de la expresión relativa de TP53 y EGFR resultó en una expresión significativamente más elevada en las muestras tumorales en comparación a las no tumorales para ambos genes. En conclusión, los genes TBP, GUSB y HMBS son válidos como genes de referencia para la normalización de genes de interés en estudios de expresión génica del CR de células claras en la población peruana.