Identificación de polimorfirmos del gen BoLA DRB3 – Exón 2 (Bovine Linphocyte Antigen) en bovinos criollos peruanos (Bos taurus Linneaus, 1758) mediante el método SSCP (Single Strand Conformation Polimorphism)
Fecha
2014Autor
Poquioma Hernández, Hilda Vanessa
Poquioma Hernández, Hilda Vanessa
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítemResumen
El antígeno leucocitario bovino (BoLA) y algunos de sus alelos han sido
identificados y asociados con variedad de enfermedades; sin embargo no
hay reportes sobre el estudio de este gen en bovinos criollos peruanos.
Con el objetivo de determinar los polimorfismos del gen DRB3 exón 2, un
total de 299 bovinos criollos provenientes de las regiones de Ancash,
Apurímac, Ayacucho, Huancavelica, Junín, La Libertad y Puno, fueron
analizados mediante la técnica de Electroforesis de detección de
polimorfismos conformacionales de cadena simple (SSCP) con un
posterior proceso de secuenciamiento. Patrones de diversidad y
estructuración genética así como análisis filogenéticos fueron conducidos.
Los niveles de diversidad genética (π) y haplotípica (h) fueron altos para
todas las regiones analizadas así como para la población total (π =
0.921). Se logró identificar 34 genotipos diferentes compuestos por 27
alelos de los cuales 6 son nuevos y 21 previamente reportados. Los alelos
*1801, *14011 y *4802 fueron los más frecuentes en las poblaciones
analizadas, siendo de gran importancia pues reportan asociación a
mastitis y resistencia a garrapatas. Por otro lado, el alelo *1501 no
presentó tan alta frecuencia, pero fue común para todas la poblaciones.
No se registró algún tipo de estructuración poblacional (AMOVA) entre las
regiones estudiadas, lo que es soportado por las pequeñas distancias
genéticas encontradas y los análisis de coordenadas principales. Test de
detección de selección natural fueron conducidos, y revelan un posible
cuello de botella en las poblaciones analizadas. Análisis filogenéticos
muestran agrupaciones similares bajo diferentes metodologías y sitúan a
la población de La Libertad en una rama más alejada al resto de las
poblaciones. Los resultados obtenidos, soportan una alta diversidad
genética para el gen DRB3 exón 2 en poblaciones de bovinos criollos
peruanos adaptados a las zonas alto andinas; diversidad que puede ser
explicada por los múltiples orígenes de este germoplasma (producto de
ganado europeo introducido durante la conquista así como introducción
de nuevo material genético en los últimos 50 años), lo cual constituye
información relevante para el establecimiento de programas de mejora
genética que eleven la productividad de los criadores de la región.
The bovine leukocyte antigen (BoLA) and some of its alleles have been
identified and associated with a variety of diseases; however there are no
reports on the study of this gene in Peruvian Creole cattle. In order to
determine polymorphisms DRB3 gene exon 2, 299 Creole cattle from the
regions of Ancash , Apurimac , Ayacucho , Huancavelica , Junín , La
Libertad and Puno, were analyzed by the technique of electrophoresis
detection of polymorphisms single stranded conformational (SSCP) with
subsequent sequencing process . Patterns of diversity and genetic
structure and phylogenetic analyzes were conducted. The levels of genetic
diversity (π) and haplotype (h) were high for all regions and analyzed for
the total population (π = 0.921). We identified 34 different genotypes
consisting of 27 alleles, 6of which are new and 21 previously reported .
The alleles * 1801, * 14011 and * 4802 were more frequent in the
populations analyzed, being of great importance as reported association
mastitis and resistance to ticks. On the other hand, the allele * 1501
presented not as high frequency, but it was common to all populations .
Some kind of population structure (AMOVA) among the studied regions
were recorded , which is supported by small genetic distances
encountered and principal coordinates analysis. Test to detect natural
selection were conducted, and reveal a potential bottleneck in the
populations analyzed. Phylogenetic analyzes show similar groupings
under different methodologies and located in the town of La Libertad in the
more remote locations other branch. The results obtained support a high
genetic diversity for the DRB3 gene exon 2 in Peruvian Creole cattle
populations adapted to the highlands; diversity can be explained by the
multiple origins of this germplasm (product of European cattle introduced
during the conquest and introduction of new genetic material in the last 50
years), which is relevant information for the establishment of breeding
programs that raise productivity of farmers from the region.
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- Biología [175]